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自宅PCやゲーム機で「世界最強スパコン」に参加、新型コロナ研究の挑戦

引用元: 自宅PCやゲーム機で「世界最強スパコン」に参加、新型コロナ研究の挑戦


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1: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:40:13.18 ID:QO9Y/suU9
https://afpbb.ismcdn.jp/mwimgs/1/f/1000x/img_1f736aa9d3032aaf8760d31881d7d2ee245865.jpg

【3月27日 AFP】ゲーム愛好家やビットコイン採掘者(マイナー)、大小さまざまな民間企業が力を合わせ、新型コロナウイルス治療の研究を加速させようと取り組んでいる。

 計算生物学者らの率いるプロジェクト「Folding@Home(フォールディング・アット・ホーム)」では、個人・企業が所有するパソコンやゲーム機の余剰パワーを結集し、前例のないデータ高速処理を実現。ウイルスの構造解析に必要な数兆桁の計算に対応できる事実上世界最強のスーパーコンピューターを開発した。

 プロジェクトの拠点は米セントルイス・ワシントン大学(Washington University in St. Louis)。プロジェクトディレクターのグレッグ・ボウマン(Gregory R. Bowman)助教授(生化学・分子生物物理学)によれば、この2週間で40万人以上が「Folding@Home」専用アプリをダウンロードした。

 多数のコンピューターをネットワーク接続して仮想スーパーコンピューターを構築する「分散コンピューティング」を用いたこのプロジェクトは、もともと20年前に米スタンフォード大学(Stanford University)で始まったものだ。クラウドソーシングにより強化した演算能力でシミュレーションを行い、病気について、特に病原体の致死性を高める「たんぱく質の折りたたみ(フォールディング)」の異常について、理解を深めるため設計された。

 今回の取り組みでは大規模な解析によって、新型コロナウイルスの構造上に治療薬が干渉できる「ポケット(穴)」を見つけ出そうとしている。

「主要目的は、治療薬の結合部位を探すことだ」とボウマン氏。強力な仮想スーパーコンピューターでは、候補となった薬剤の治療効果をシミュレーションで確認できる。コンピューター創薬と呼ばれる手法だ。

 プロジェクトチームが以前エボラウイルスで治療薬の標的を発見していることや、新型コロナウイルスの構造が既存研究の多い重症急性呼吸器症候群(SARS)ウイルスと似ていることから、ボウマン氏は楽観的な見通しを示している。「近い将来に最も期待がかかるのは、いずれかの部位に結合できる既存の薬剤を見つけられるかどうかだ」

■無限の演算能力で無力感に対抗

「Folding@Home」プロジェクトを支えるのは、個人所有のパソコンや「プレイステーション(PlayStation)」などのゲーム機、よりパワフルな事業用のコンピューターやサーバーから集約した演算能力だ。「原理上、われわれが利用できるコンピューター能力は無限だ」とボウマン氏は言う。

 比較的最近のコンピューターを持っていれば、誰でもプロジェクトに貢献できる。インストールしたプログラムアプリが少量のデータをダウンロードして解析を行い、参加者は協力対象の病気を選択することもできる。

 米マイクロソフト(Microsoft)傘下のソフトウエア開発プラットフォーム「ギットハブ(GitHub)」など、IT大手も参加している。

 ゲーム機向けの強力なグラフィックチップを製造する米エヌビディア(NVIDIA)は、ゲーマーたちにプロジェクト参加を呼び掛けた。同社広報によれば「反響は記録的で、数万人が新たに参加した」という。

 中でも、ソーシャルニュースサイト「レディット(Reddit)」のパソコン・ゲーム愛好家グループの貢献は大きい。約2万4000人のメンバーを抱えるこのグループを率い、「Folding@Home」プロジェクトの顧問でもあるポルトガル在住の弁護士ペドロ・バラダス(Pedro Valadas)氏は、「無力感に対抗できる素晴らしい武器だ」とこの取り組みを称賛した。(c)AFP/Rob Lever

2020年3月27日 19:56 
https://www.afpbb.com/articles/-/3275417

42: 名無しさん 2020/03/28(土) 11:43:52.17 ID:y1cJSUGC0
>>1
Team2chもRedditと同じくらい貢献度あるんだけど
取り上げられない哀しさw

47: 名無しさん 2020/03/28(土) 12:41:06.68 ID:zAvecWIA0
>>1
参加方法がワカラン

エロい人やり方教えろください。

48: 名無しさん 2020/03/28(土) 12:58:44.60 ID:MlkvDBh30
>>47
Folding@Homeで難病解明 Part5【FAH】
https://medaka.5ch.net/test/read.cgi/pc/1222876981/

49: 名無しさん 2020/03/28(土) 13:18:35.51 ID:zAvecWIA0
>>48
さんくす。

そのスレの1に書かれてるDLURLだとNOT FOUNDになるけど、
F@Hのホームに行くと普通に「START FOLDING NOW」のリンクがあった。
https://foldingathome.org/
https://foldingathome.org/start-folding/

> ダウンロードしたら早速開始して名前を登録、
> チーム番号に162と入れればチーム2chに入れます。

把握。やってみるわ。

55: 名無しさん 2020/03/28(土) 16:41:06.45 ID:/cw5c/Be0
今までBOINC・WCGに全力でリソース割り当ててたけど
この土日で仮想構成に作り替えて>>1のやつにも振り分けるお

>>4
呼んだ?UDでしょ?
プロジェクトいきなり終了したのでオレはWCGに引っ越した

2: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:41:09.22 ID:THUw2xLk0
採掘かよ

3: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:41:28.71 ID:VwMvtqCf0
5時間以上掛かるから一回やってアンインストールした

4: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:41:52.90 ID:foEOI1BE0
白血病の解析プロジェクトで、似たようなものが、18年ぐらい前にあった
インストールしてパソコンに少しずつ解析させる奴

何の意味もなかったと聞いてショックだったわ

19: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:46:51.69 ID:Soe8TNEo0
>>4
にちゃんの各板でやってたね
意味なかったのか

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24: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:51:08.99 ID:sIjpeFV80
>>4
一時期2chで流行ったね
板対抗とかやってた気がする

44: 名無しさん 2020/03/28(土) 11:45:52.50 ID:p1aHdhOT0
>>4
え、無意味だったんw

SETIとかやってたわ、宇宙からの電波解析だかのやつ

46: 名無しさん 2020/03/28(土) 12:34:37.04 ID:Kg2saVKN0
>>44
こ、このスペクトル(?)は!? 奴がついに目覚めると言うのかッ!

みたいな中二病ごっこに役立ったのでヘーキヘーキ

56: 名無しさん 2020/03/28(土) 17:28:28.49 ID:Ou4WW4mh0
>>4

懐かしいな。

5: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:42:30.98 ID:EY7iy07Z0
BOINCでやってるなら協力できるな

6: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:42:34.87 ID:zvfF/nWc0
二番じゃダメなんですか?

9: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:44:10.65 ID:nEU7Zn4h0
エリザベス女王が倒れたらしいが 真意は不明 にしても【戦争が避けられないか!】
>>6
マスク製造の指示をだせ

7: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:43:26.65 ID:7IqA3NCb0
うちのPS2使っていいぞ

8: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:44:05.23 ID:KTg/Yip30
元気玉みたいな感じか 攻殻機動隊でもジジイの脳みそ借りてたな

10: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:44:21.04 ID:AyMRkgPt0
消費電力はあんま増えないね
これなら続けられそうだけど

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11: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:44:25.10 ID:MU+6ZVO00
やってるよー

12: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:44:59.55 ID:kBwhtF7r0
マジかよ
俺のラズベリーパイ3が火を吹くぜ

36: 名無しさん 2020/03/28(土) 11:10:20.80 ID:+46UZ75EO
>>12
あれ実用に耐えれる?
mathematica使えるからちょっと欲しいけど
数千円の機械に期待する方が無駄か

13: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:45:18.24 ID:FvawXdWk0
在宅が多い今こういうの面白いな
コロナ在宅で集まるって何かを成し遂げるのは熱くなりそう

14: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:45:20.12 ID:bAJrU+Q30
PS3の時に似てるのやったな

15: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:45:20.81 ID:WHcuZChY0
750tiなら貸したる

16: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:45:48.70 ID:ToL45FcY0
setiもタンパク質も解析終わったけど結果出てないよね

21: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:48:54.02 ID:JB3p9Xj90
>>16
うちも昔家中のPC使って参加してたな
懐かしい
setiってまだあるんだ

30: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:54:46.03 ID:ToL45FcY0
>>21
今月で21年のプロジェクトは終了
成果なし

17: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:45:49.64 ID:A5JW9iWO0
IP抜かれて攻撃されやつ~

18: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:46:28.98 ID:9yeXY/8j0
中華製のサイトだかアプリで勝手にやってるんでしょ?

20: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:48:43.31 ID:Kg2saVKN0
setiは何か解析してるっぽい画像が表示されてたけど、これは何も表示されないタイプだっけ?
イマイチ地味で一般受けは難しそうね。ただPCの負荷が増す感じで何かやってる感に乏しい…

22: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:49:50.79 ID:EytgQwfv0
俺の相棒が遂に火を吹く時が来たか

50: 名無しさん 2020/03/28(土) 13:46:37.75 ID:3GSsf7240
>>22
物理的に?

23: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:50:23.73 ID:FzZmtqAH0
計算で何とかなるようなもんなの?

35: 名無しさん 2020/03/28(土) 11:10:11.60 ID:N7wgU7z60
>>23
うまくいくかもしれない。少なくとも、この薬は効くかもしれない、
ウイルスのここを狙えばいいかもしれない、など可能性を示すことはできる
でも実際は計算予測と違ったり、体内では毒性があったりしてダメなことも多い

25: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:51:53.54 ID:FzZmtqAH0
この手で実際に意味があったのはブロックチェーンぐらいじゃないの?
動画のエンコードとか3Dレンダリングには役に立つかもしれないけど

26: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:52:36.91 ID:v4kTVcf80
知らない内に個人情報も奪われるとか?

27: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:53:29.32 ID:d4gHwzZp0
※PCや参加した方の個人情報はLINEで管理されております

28: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:53:42.18 ID:bWO5esZ40
白血病の解析はどうなったの?

29: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:54:14.51 ID:6k/BJNX+0
皆さんのパソコンの中身をせっせとすいあげてるんだろ?

31: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:55:29.82 ID:e4nLpNC60
いやいや、どうせ大した業務じゃないのにクラウド化しているような糞サーバ止めればいいだけ
たぶんコロナ騒動があと半年続くようなら、クラウドサービス次々に値上げか停止だとおもうよ

クラウドからサーバの雨が降る
オンプレを棄てた企業の阿鼻叫喚

32: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:55:56.26 ID:MlkvDBh30
最近始めた
i7 8700とRTX2080tiでPPD29万ぐらい
3950Xに変えたらPPD跳ね上がるかな

33: 名無しさん 2020/03/28(土) 10:56:39.81 ID:hgDjdpk60
宿題に見せかけて仮想通貨掘らせたり

34: 名無しさん 2020/03/28(土) 11:01:48.92 ID:BjvnwCr30
使ってないPS3があるんだが役に立つのか

37: 名無しさん 2020/03/28(土) 11:16:40.66 ID:lFf85G4f0
一言でいうと元気玉

38: 名無しさん 2020/03/28(土) 11:21:10.10 ID:FzZmtqAH0
社会的問題の解決のために計算資源を集めた、というよりは分散処理の実証実験のために社会的問題をダシに使った、
って方が近いのだろうな
こういう見かけが派手なのは、実際には意味がなくても研究予算も付きやすいのかもしれない

39: 名無しさん 2020/03/28(土) 11:26:19.74 ID:W/BFufqv0
boinc昔参加したけど仮想通貨掘ってたほうがましww

40: 名無しさん 2020/03/28(土) 11:33:15.08 ID:MGU/EXO+0
マイニングに使っている奴を転用できれば・・

53: 名無しさん 2020/03/28(土) 15:11:01.21 ID:pkDihix/0
>>40
マイニングに使うようなマシンは個人の家で動かすレベルでも1日の電気代が数千円だぞ
ボランティアできるような金額じゃないな

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41: 名無しさん 2020/03/28(土) 11:35:12.04 ID:UrAj9KCo0
Wolframでよくね?

43: 名無しさん 2020/03/28(土) 11:44:31.50 ID:SY5zcNqs0
ええから黙ってやれ

成果はfolding@homeのサイトに発表された論文が載ってる

45: 名無しさん 2020/03/28(土) 11:49:36.66 ID:p1aHdhOT0
nvidiaが自社リソースをコロナ研究者に開放したとか

52: 名無しさん 2020/03/28(土) 14:30:09.76 ID:2DMq2Yuv0
こっそりビットコイン採掘させるプログラムを
似た名前で公開してやれば儲かるんじゃね?

と云うニュースまだ?

54: 名無しさん 2020/03/28(土) 15:43:31.41 ID:+5Z6zgJ80
新型コロナ解析で分散処理プロジェクト「Folding@home」が1EFLOPS超え
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1243230.html

>世界最速を誇る米オークリッジ国立研究所に設置されたスーパーコンピュータ「Summit」の連続最高性能は149PFLOPS(ペタフロップス)であり、1EFLOPSはTOP500の上位100スーパコンピュータの合算を上回る。

58: 名無しさん 2020/03/28(土) 18:35:11.88 ID:YI3F5V7C0
中途参加

59: 名無しさん 2020/03/28(土) 18:35:29.28 ID:YI3F5V7C0

57: 名無しさん 2020/03/28(土) 17:31:01.93 ID:GIyj4oqP0
まあ、昔から演算能力貸し出すのあるからな

こういうので成果出たって聞かないな

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